Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm28048F7BCN0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm28048F7BCN0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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