Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Susd1E9Q3H4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms