Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms