Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms