Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms