Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms