Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2012B1B0R1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2012B1B0R1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms