Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms