Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm13941A2AJ38 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm13941A2AJ38 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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