Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm2A2A7B5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms