Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrit3W8DXL4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrit3W8DXL4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrit3W8DXL4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrit3W8DXL4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrit3W8DXL4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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