Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28036V9GXJ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28036V9GXJ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms