Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3bQ9Z321 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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