Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer1Q9Z2Y3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer1Q9Z2Y3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms