Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptgdr2Q9Z2J6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms