Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc23a1Q9Z2J0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc23a1Q9Z2J0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms