Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rlbp1Q9Z275 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rlbp1Q9Z275 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms