Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc45Q9Z1X9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc45Q9Z1X9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc45Q9Z1X9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms