Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17h6s53eQ9Z1R4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17h6s53eQ9Z1R4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17h6s53eQ9Z1R4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17h6s53eQ9Z1R4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
D17h6s53eQ9Z1R4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
D17h6s53eQ9Z1R4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D17h6s53eQ9Z1R4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D17h6s53eQ9Z1R4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms