Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cog1Q9Z160 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog1Q9Z160 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms