Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dctn3Q9Z0Y1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms