Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms