Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slfn1Q9Z0I7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms