Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap4s1Q9WVL1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4s1Q9WVL1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms