Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a4Q9WV27 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a4Q9WV27 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms