Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1bQ9WU38 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms