Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrf1Q9WU00 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nrf1Q9WU00 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrf1Q9WU00 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms