Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn8aQ9WTU3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn8aQ9WTU3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms