Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trex2Q9R1A9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms