Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfwd2Q9R1A8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms