Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt9Q9R0N9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms