Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcm1Q9R0L6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcm1Q9R0L6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcm1Q9R0L6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcm1Q9R0L6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcm1Q9R0L6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcm1Q9R0L6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms