Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt71Q9R0H5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms