Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod1Q9R0E2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms