Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod3Q9R0E1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod3Q9R0E1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Plod3Q9R0E1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms