Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtsfQ9R013 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms