Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk3Q9QZL0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk3Q9QZL0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms