Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Copg1Q9QZE5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms