Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn8Q9QZ49 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn8Q9QZ49 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms