Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Six6Q9QZ28 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms