Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phtf1Q9QZ09 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phtf1Q9QZ09 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms