Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp1Q9QY53 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nphp1Q9QY53 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms