Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Apbb1Q9QXJ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms