Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChmQ9QXG2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChmQ9QXG2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms