Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr4Q9QUK6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tlr4Q9QUK6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms