Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln8Q9QUK3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms