Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkl2Q9QUK0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms