Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh9a1Q9JLJ2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aldh9a1Q9JLJ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aldh9a1Q9JLJ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aldh9a1Q9JLJ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aldh9a1Q9JLJ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms