Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rfx5Q9JL61 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms