Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ldb3Q9JKS4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ldb3Q9JKS4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms